Auf dem Gelände der Justizvollzugsanstalt Düsseldorf stehen 17 Häuser, die, je nach Funktionalität/Schwerpunkte, in unterschiedliche Abteilungen oder Bereiche aufgeteilt sind:
- Verwaltung
- Pforte/KFZ-Schleuse
- Sportbereich
- Küche
- Untersuchungshaftbereich
- Strafhaftbereich
- Zugangsabteilung
- Transportabteilung
- Begegnungszentrum
- Schulungsbereich
- Medizinischer Bereich
- Werkbetriebe
- Arbeitstherapie
- Fahrdienst
- Technik
- Besuch
- Kammer
- Sicherheit
- Fachdienstbereich
- Ausbildungsbereich für Bedienstete
Laut § 14 Strafvollzugsgesetz NRW und § 10 Untersuchungshaftvollzugsgesetz NRW, werden die Inhaftierten alleine untergebracht. In Ausnahmefällen dürfen sie auch zu Zweit untergebracht werden. Demzufolge ist die Justizvollzugsanstalt Düsseldorf mit 695 Einzel- und 80 Doppelhafträumen ausgestattet. Zu den Einzelhafträumen gehören u.a. auch 4 Barrieren freie Hafträume für Inhaftierte mit erheblichen körperlichen Behinderungen.
Der Haftbereich der Justizvollzugsanstalt Düsseldorf ist in 16 Abteilungen abgrenzend aufgeteilt. Als Standard befinden sich auf jeder Abteilung Duscheinrichtungen, Freizeit- und Gruppenräume mit Küchenzeile, Wäscheräume mit Waschmaschinen und Wäschetrockner, Multifunktionsbüros und Sozialräume.